انقلاب اسلامی تنها پاسخ درخور به تمدن غرب بود. روح تمدن غرب، استغنای از انبیاست. طبعاً با انقلاب اسلامی که در نقطه مقابل تمدن غرب، داعیه‌دار مرجعیت دین و نیاز به دین است، نقش روحانیت هم افزایش پیدا می‌کند.
استاد میرباقری، رئیس فرهنگستان علوم اسلامی قم، مأموریت جدید روحانیت را تبیین تئوری حکمرانی اسلامی و نیروسازی برای آن عنوان و ابراز کرد: امام با فقاهت خودش انقلاب کرد و با کمک تعدادی از فقها نظام‌سازی کرد؛ ولی مدل حکمرانی اسلامی را باید حوزه به‌عهده می‌گرفت که این کار انجام نشد، حوزه نقش خودش را در زمینه حکمرانی اسلامی ایفا نمی‌کند.
وی ادامه داد: برخی می‌گویند انقلاب اسلامی باعث افت مرجعیت روحانیت شد، درحالی‌که مرجعیت روحانیت با تجدد از او گرفته شد و انقلاب اسلامی آن را دوباره بازگرداند. منتهی یک علت کاهش استقبال از حوزه این است که روحانیت نقش تخصصی خودش را در اداره جامعه مشخص نکرده است.
این عضو مجلس خبرگان رهبری در بخشی از سخنان خود با اشاره به اهمیت تبلیغ در حوزه‌های علمیه، تاکید کرد: تبلیغ ما باید تبلیغ در تراز حکومت و تمدن باشد. ما درحالی انقلاب کردیم که تمدن غرب می‌گفت دین در مقابل آزادی است و تمدن شرق می‌گفت دین در مقابل عدالت است. حوزه در تبیین حرف انقلاب چه کرد؟
رئیس فرهنگستان علوم اسلامی با باین اینکه الگوی سازندگی ما به شدت غربی است، اذعان کرد: الآن کشور با علوم انسانی اداره می‌شود؛ نه با فقه. ما فقط با شورای نگهبان بر خروجی آن نظارت می‌کنیم. در مجمع تشخیص مصلحت هم معمولاً نظر کارشناسان بر فقه می‌چربد.
استاد میرباقری در پایان گفت: به ما می‌گویند شما تئوریسین جنگ هستید. ما می‌گوییم تئوریسین جنگ، آمریکاست‌؛ ولی شما تئوریسین تسلیم هستید و ما تئوریسین مقاومت. غرب‌زده‌ها اسم تئوری سازش و تسلیم را به‌دروغ می‌گذارند تئوری صلح! و اسم «تئوری مقاومت» را می‌گذارند تئوری جنگ! حتماً ما صلح‌طلبیم؛ اما صلح پایدار از بستر مقاومت می‌گذرد، نه از بستر تسلیم و ذلّت.