به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی شورای‌عالی حوزه‌های علمیه، حجت‌الاسلام و‌المسلمین سیدحسین حسینی که از سوی آیت‌الله اعرافی، مدیر حوزه‌های علمیه سراسر کشور، جهت مدیریت حوزه علمیه یزد پیشنهاد شده بود، در دویست و پنجاه و دومین جلسه شورای‌عالی حوزه‌های علمیه، به‌تأیید اعضای این شورا رسید تا به‌مدت 3 سال عهده‌دار مدیریت حوزه‌های علمیه این استان باشد.
شایان ذکر است، پیش از وی، حجت‌الاسلام و‌المسلمین محمد شمس، مدیریت حوزه علمیه این استان را بر عهده داشت.