رهبر انقلاب اسلامی، آیت‌الله میلانی(قد) را از لحاظ فردی، شخصی ممتاز و دارای وقار و متانت و در عین حال تواضع، وفاداری نسبت به دوستان و برخوردار از لطافت روحی و ذوق شعر توصیف کردند و افزودند:
آن‌مرحوم از لحاظ علمی، یک ملّای بزرگ بود که از محضر اساتیدی همچون مرحوم نائینی و مرحوم شیخ محمدحسین اصفهانی بهره برده و در «درس و بحث علمی» خوش‌بیان بود و طلبه‌های فاضلی را پرورش می‌داد.
 
کنگره بزرگداشت پنجاهمین سالگرد ارتحال آیت‌الله‌العظمی سید محمدهادی میلانی (قد) با پخش سخنان امام خامنه‌ای در دیدار دست‌اندرکاران این کنگره، قرائت پیام مرجع معظم آیت‌الله‌العظمی سبحانی تبریزی و سخنرانی آیات؛ شب‌زنده‌دار دبیر شورای عالی حوزه‌های علمیه، مروی دبیر دوم این شورا، اعرافی مدیر حوزه‌های علمیه کشور، حسینی خراسانی عضو خبرگان رهبری، سیدان استاد برجسته حوزه علمیه مشهد، علم‌الهدی نماینده ولی فقیه در خراسان رضوی و حجت‌الاسلام والمسلمین احمد مروی تولیت آستان قدس رضوی پنجشنبه 4 دی در تالار قدس حرم مطهر رضوی، در مشهد مقدس برگزار شد.