متن بیانیه جامعه مدرسین حوزه علمیه قم در پی شهادت رهبر معظم انقلاب اسلامی حضرت آیت‌الله‌العظمی امام خامنه‌ای بدین شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
[مِنَ الْمُؤْمِنِینَ رِجالٌ صَدَقُوا ما عاهَدُوا اللّهَ عَلَیْهِ فَمِنْهُمْ مَنْ قَضى نَحْبَهُ وَمِنْهُمْ مَنْ یَنْتَظِرُ وَما بَدَّلُوا تَبْدِیلاً]
نائب بر حق حضرت ولی‌عصر(عج)، پیشوای مسلمانان و آزادگان جهان، خلف شایسته امام خمینی(قد)، حضرت آیت‌الله‌العظمی امام خامنه‌ای(رض)، در ماه رمضان چون مقتدایش امیرالمؤمنین(ع) شهد شهادت نوشید و ایران و ملت‌های آزاده را در سوگی بزرگ نشاند.
مقتدای مقتدر و شجاع انقلاب اسلامی(اعلی‌الله مقامه) در طول تقریباً چهاردهه هدایت‌های داهیانه خود، ایران اسلامی را به الگویی مثال‌زدنی برای آزادگان عالم تبدیل کرد و به‌معنای واقعی، امید را در دل مستضعفان زنده کرد و لرزه به اندام مستکبران انداخت و اسطوره بی‌نظیر مقاومت در برابر طاغوتیان لقب گرفت.
جامعه مدرسین حوزه علمیه قم، این مصیبت جانسوز را به حضرت ولی‌عصر (ارواحنا لتراب مقدمه الفداء)، ملت رشید ایران، بیت معظم‌له، امت بزرگ اسلامی، مراجع عظام تقلید، علماء و حوزه‌های علمیه و تمامی آزادگان عالم تسلیت می‌گوید.
اکنون بر مجلس خبرگان رهبری است تا طبق قانون اساسی جمهوری اسلامی ایران، به‌هنگام و با قاطعیت، رسالت خویش را که شرعاً و قانوناً فصل‌الخطاب است، تحقق بخشد.
حفظ انسجام و حرکت در مسیر باورهای اسلامی و شیعی، مهم‌ترین توصیه آن بزرگ مرد عرصه علم و عمل بود که ملت شریف ایران با تحقق‌بخشیدن به آن، به‌خوبی خواهد توانست، توطئه مستکبران عالم را نسبت به ایران اسلامی خنثی نموده و بقای نظام مبارک جمهوری اسلامی ایران تا ظهور دولت جهانی حضرت مهدی (ارواحنا فداه) را تضمین بخشد.
رژیم جنایت‌کار آمریکا و صهیونیسم خون‌خوار بدانند، ملت بصیر ایران با تجدید بیعت با آرمان‌های امام خمینی و امام خامنه‌ای(قد) و شهدای انقلاب، لحظه‌ای در راه مبارزه با جنایت‌کاران، به خود تزلزل راه نداده و غیرتمندانه، خشم مقدس خود را تا نابودی آمریکای جنایت‌کار و رژیم غاصب صهیونیستی حفظ خواهد کرد.
[وَسَيَعلَمُ الَّذينَ ظَلَموا أَيَّ مُنقَلَبٍ يَنقَلِبونَ]
جامعه مدرسین حوزه علمیه قم