این مراسم که از سوی آیت‌الله سیدمجتبی حسینی خامنه‌ای ترتیب داده شده بود، از نخستین ساعات عصر با تلاوت قرآن و سرود ملی آغاز شد و طی آن شخصیت‌های سیاسی، نظامی و دیپلماتیک به ابراز همدردی با بازماندگان پرداختند.
در این مراسم فرزندان رهبر شهید امت(ره)، سران قوای سه‌گانه، سفرای خارجی و نمایندگان کشورهای مختلف که برای عرض تسلیت به سران قوا و خانواده شهید به محل آمده بودند، حضور داشتند.
به گزارش ایلنا، آیت‌الله سید مصطفی حسینی خامنه‌ای در این مراسم بزرگداشت ضمن ابلاغ پیام تشکر رهبر انقلاب از ملت ایران و عراق و دست‌اندرکاران برگزاری مراسم تشییع و تدفین و بدرقه رهبر شهید انقلاب، گفت: ابتدا این شهادت بزرگ را به محضر مولای حاضر و ناظرمان، حضرت بقیة‌الله‌الاعظم(عج)، و سپس به همه امت اسلامی، ملت عزیز ایران و شما برادران و خواهران تبریک و تسلیت عرض می‌کنم. در مواجهه با این مصیبت بزرگ، موضوع «صبر» مطرح است؛ همان‌طور که در قرآن کریم بر آن تأکید شده است.
وی ادامه داد: اما صبر به معنای حقیقی آن، بدین معناست که این مصیبت بزرگ را به‌گونه‌ای تحمل کنیم که راهمان را با صلابت و درستی ادامه دهیم و تا رسیدن به هدف نهایی پیش برویم. بنابراین، صبر هیچ منافاتی با انتقام و برخورد با اشرار عالم که در این جنایت‌های بزرگ دست داشته‌اند، ندارد. نکته دوم اینکه ما در حوادث بزرگ هفته گذشته و در تشییع پیکر امامِ شهیدِ امت، شاهد جلوه‌ای از توحید بودیم که باید قدر آن را بدانیم.
فرزند ارشد رهبر شهید انقلاب اسلامی افزود: در هر جامعه‌ای اگر امام آن جامعه مِنَ‌الله باشد، امت آن جامعه که تابع آن امام هستند، به عالم بالا و آسمان متصل خواهند شد. در چند روز گذشته جلوه جدیدی از برکات فراوان الهی جلوه‌گر شد و همه عالم شاهد عظمت آن بودند و باید برای تجلی عظیم توحیدی به امت اسلامی و ملت شریف ایران تبریک گفت. همه باید منتظر باشند که پس از این، برکات بی‌شمار و فراوان الهی را در محیط الهی خود ببینند.
آیت‌الله سیدمصطفی حسینی خامنه‌ای ضمن ابلاغ پیام قدردانی و تشکر رهبر انقلاب از مردم ایران و عراق برای حضور در تشییع میلیونی آقای شهید ایران، گفت: پس از مقدمه‌ای که پیرامون این رستاخیز چشمگیر و بی‌سابقه عرض شد، بنده موظف هستم پیام تشکر و تقدیر رهبری معظم و معزز را به‌خاطر برپایی این حماسه بزرگ، به همگان ابلاغ کنم.
فرزند رهبر شهید انقلاب اسلامی افزود: مردم عزیز ایران که با وفاداری و بصیرت فوق‌العاده خود، این صحنه را چنان آراستند که تحمل آن برای دشمن بسیار سنگین بود. حضور میلیونی شما در تهران، قم، مشهد و سراسر کشور، معنای خاصی داشت که ان‌شاءالله در آینده شاهد برکاتِ آن خواهیم بود.
وی تأکید کرد: همچنین لازم است از متصدیانِ محترم، چه دولت گرامی و چه دستگاه‌های دیگر که در این زمینه تمهیدات فراوانی انجام دادند، قدردانی کنم؛ از برادران عزیز سپاه، بسیج، نیروهای انتظامی و سایر دستگاه‌ها.
آیت‌الله سیدمصطفی حسینی خامنه‌ای تصریح کرد: مراتب قدردانی را نسبت به مردم عزیز عراق دارم که با وفا و بصیرت خویش، صحنه‌ای فوق‌العاده را رقم زدند؛ چه در شهرهای نجف اشرف و کربلای معلی و چه در مسیر بین نجف و کربلا .
وی ادامه داد: از همه آنان، از بسیج مردمی عزیز عراق و دولت محترم عراق سپاسگزاری می‌کنم. امیدواریم که خدای متعال همه ما را ثابت‌قدم بدارد و توفیق دهد که این راه را که خود در مقابل ما گشوده است، به‌خوبی طی کنیم و به اهداف بلند و متعالی انقلاب اسلامی دست یابیم.
گزارش‌ها حاکی از آن است که شرکت‌کنندگان از شهرهای مختلف برای حضور در این مراسم به تهران آمده بودند و تدابیر امنیتی و ترافیکی ویژه‌ای در اطراف مصلای امام خمینی(ره) برقرار بود تا تردد جمعیت تسهیل شود.